ワンピースのヤマトは仲間にならないのはなぜ？

結論

簡潔に言うと、ヤマトは海に出ないまま麦わらの一味とともにワノ国で別れることになります（コミックス1057話）。ただし、ルフィからは仲間として認められているため、今後再び合流する可能性も残されています。